Dem IFF gehören Professorinnen, wissenschaftliche und nichtwissenschaftliche Mitarbeiterinnen sowie Studierende an. Die Mitarbeit im IFF steht allen in der Frauen- und Geschlechterforschung engagierten Studierenden, Lehrenden und Forschenden offen.
Das IFF wird von einem Vorstand geleitet. Diesem gehören Professorinnen aus unterschiedlichen Fakultäten der Universität Bielefeld an. Ein wissenschaftlicher Beirat berät den Vorstand. Er wird durch den Senat der Universität Bielefeld für eine Amtszeit von vier Jahren gewählt.
Im IFF arbeiten - finanziert über den Haushalt der Universität - eine wissenschaftliche Mitarbeiterin als Koordinatorin und eine wissenschaftliche Mitarbeiterin zur Projekteinwerbung und -betreuung sowie eine Sekretärin. Weitere WissenschaftlerInnen arbeiten in Forschungsprojekten, die über Drittmittel finanziert werden, sowie als wissenschaftliche und studentische Hilfskräfte.