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Der Bereich vereint ein breites Spektrum an Grundlagenforschung und biotechnologischen Projekten mit modernster molekulargenetischer und systembiologischer Methodik. Ein Schwerpunkt liegt auf den molekularen Grundlagen der Signalperzeption, Signaltransduktion und Signalintegration als Reaktion auf abiotischen Stress, Veränderungen im Redoxmilieu oder Pathogenbefall, sowie daraus resultierenden Veränderungen im Transkriptom, Proteom und Metabolom in Bakterien, Pflanzen und Tieren. Ferner werden Entwicklungs- und Differenzierungsprozesse in Modellorganismen untersucht, z.B. Differenzierung neuronaler Stammzellen, Modulation des Cytoskeletts, Zellspezifikation bei Volvox und Blühinduktion bei Arabidopsis. Viele Projekte werden in interdisziplinären Kooperationen, z.B. im SFB613 „Physik von Einzelmolekülprozesse und molekularer Erkennung“ durchgeführt. In anwendungsorientierten Projekten werden Systeme zur Produktion von „biofuels“ oder Ressourcen für Genomprojekte bei Arabidopsis, Nutzpflanzen und biotechnologisch relevanten Mikroorganismen entwickelt.